Stelle frei: Ab sofort

Entwicklung von Tools für die Sauerstoffmessung in 3D-Zellkulturen

Jobbeschreibung
Mit CAVIGEN entwickeln wir die CaviSphere®-Plattform für mikrostrukturierte 3D-Zellkulturen mit integrierter Sauerstoffmessung. Neben der Hardware arbeiten wir an digitalen Werkzeugen, die komplexe Bild- und Messdaten aus 3D-Zellkulturassays strukturiert, automatisiert und verständlich auswertbar machen.
Deine möglichen Schwerpunkte
A) Bildauswertung & Datenanalyse
Entwicklung erster Python-basierter Auswerteskripte für Bild- und Messdaten
Unterstützung bei automatischer Erkennung mikrostrukturierter Kavitäten
Verarbeitung, Qualitätskontrolle und Visualisierung von fluoreszenzbasierten O₂-Daten
Mitarbeit an Prototypen für standardisierte Analyse-Workflows

B) Datenplattform & Visualisierung
Unterstützung bei Datenstrukturen, Metadaten-Templates und Import-Workflows
Entwicklung erster Prototypen für Visualisierung, Reporting und Datenexport
Mitarbeit an Schnittstellen für quantitative Ergebnisse aus externen Analyse-Pipelines
Unterstützung bei der nutzerfreundlichen Aufbereitung von Assay-Daten

Dein Profil
Du studierst Bioinformatik, Informatik, Data Science, Biotechnologie, Life Science, o.Ä.
Du hast fundierte Grundkenntnisse in Python oder einer ähnlichen Programmiersprache.
Für den Schwerpunkt Bildauswertung sind Kenntnisse in OpenCV, scikit-image oder vergleichbaren Tools von Vorteil.
Für den Schwerpunkt Datenplattform sind erste Kenntnisse in Datenbanken, Webentwicklung, Visualisierung oder Datenmanagement willkommen.
Du arbeitest analytisch, strukturiert und hast Freude daran, Software für konkrete wissenschaftliche Fragestellungen zu entwickeln.
Ein Life-Science-Hintergrund ist willkommen, aber keine Voraussetzung.

Was wir dir bieten
Mitarbeit an datengetriebenen Werkzeugen für 3D-Zellkultur, Imaging und O2-Sensorik
Zusammenarbeit mit unserem interdisziplinären Team sowie externen Spezialist:innen für Softwarearchitektur und Bildauswertung
Raum für eigene Ideen und die Möglichkeit, Aufgaben nach deinen Stärken zu vertiefen
Flexible Arbeitszeiten sowie Möglichkeit zur längerfristigen Zusammenarbeit
Bei passendem Thema: Möglichkeit, Projekt- oder Abschlussarbeiten anzudockenWeitere Angaben:
Arbeitsort: Karlsruhe / Rülzheim
Arbeitszeit: 8 - 16 h/Woche
Homepage: https://cavigen.eu/jobs/